Село расположено в пределах долины реки Саракокша и ее притока реки Ынырга. В русле развиты многочисленные протоки и острова и, как следствие, при половодье населенный пункт затапливало.

Работы по расчистке и углублению русла реки Саракокша в районе села Ынырга выполнены по инициативе Главы Республики Алтай Александра Бердникова. Мероприятия проведены для увеличения пропускной способности русла реки, снижения вероятности образования заторов и высоты паводков.

Мероприятия по расчистке проводились в течение двух лет. В 2017 году выполнена расчистка русла реки протяженностью 2,58 км, вынут грунт в объеме 89,73 тыс. куб. м.

В этом году протяженность расчистки составила 0,006 км, объем вынутого грунта составил 0,211 тыс. куб. м.

По сообщению пресс-службы минприроды, выполненные мероприятия позволят предотвратить затопление 55 жилых домов, в которых проживает 174 человек, предотвратить затопление территории площадью 14,2 га, участка автодороги протяженностью 1,2 км.

Предотвращенный вероятный ущерб от негативного воздействия реки Саракокша на территорию села Ынырга оценивается в 97,843 млн рублей.