7 мая 1992 года Верховным Советом Республики Алтай издано постановление «О Постоянном представительстве Республики Алтай при Президенте Российской Федерации» в соответствии с Федеративным договором от 31 марта 1992 г.

История института представительств имеет более чем вековую историю. В советское время в разные годы председательствовали от имени региона такие общественные и политические деятели, как В.Т. Тибер-Петров, Л.А. Сары-Сеп-Конзычаков, П.А. Чагат-Строев, И.И. Зяблицкий, И.С. Алагызов, Кроловецкий (И.О. не определено).

Вновь потребность в организации представительства в Москве возникла в 1992 году.

Первым постоянным представителем Республики Алтай в ранге заместителя председателя Правительства Республики Алтай был назначен Манзыров Александр Поликарпович. Его заместителем стал Яимов Николай Эжерович. В ноябре того же года главным специалистом назначена Лозовая Ирина Петровна. Постоянное представительство ютилось в двух небольших кабинетах на Пушкинской площади в Москве в историческом здании редакции газеты «Известия».

В 2009 году была достигнута договоренность с мэром Москвы о выделении Республике Алтай отдельного здания в аренду в историческом центре столицы. Здание расположено по адресу Земляной вал, 68/18 стр.8, построено в 1836 году и приравнено к памятнику архитектуры.

А уже в 2016 году Мэр Москвы С.С. Собянин по просьбе Главы Республики Алтай принял решение о передаче здания в собственность Республики Алтай.

Полномочные представители Республики Алтай:

• Манзыров Александр Поликарпович (1992-1997г.г.).
• Шайхисламов Сергей Харисович (1997-1998 г.г.).
• Кончаковский Сергей Демидович (1998 г.)
• Бедюров Бронтой Янгович (1999 г.).
• Гнездилов Михаил Захарович (2001-2002 г.г.).
• Михайлов Вадим Александрович (апрель - июнь 2002 г.г.).
• Манзырова Надежда Чанкышевна (2002-2006 г.г.).
• Козлов Михаил Сергеевич (2006-2008 г.г.).
• Банных Анатолий Николаевич (2008- 2009 г.г.).
• Лозовая Ирина Петровна (2009-2016 г.г.).
• Демина Марина Владимировна (февраль-июнь 2016г.).
• Лозовая Ирина Петровна (2016 г. - наст. время).

Постоянное представительство Республики Алтай в г. Москве организовывает взаимодействие с федеральными органами государственной власти, с органами государственной власти субъектов РФ, организациями и общественными объединениями, находящимися в городе Москве по вопросам социально-экономического, научного и культурного развития Республики Алтай, в том числе при осуществлении внешнеэкономических связей. А также участие в заседаниях при рассмотрении у Президента РФ, в высших исполнительных органах государственной власти РФ предложений по вопросам социально-экономического и культурного развития республики.

Обеспечивает деятельность Главы Республики Алтай, Председателя Правительства Республики Алтай во время рабочих командировок в Москву.

Занимается организацией культурных и иных массовых мероприятий, связанных с национальной культурой и традициями Горного Алтая, презентацией субъекта. Оказывает всяческую поддержку землякам в Москве. Осуществляет соответствующую работу и прилагает усилия относительно защиты социальных, деловых, производственных, творческих, национально-культурных и иных общественных интересов Республики Алтай.

Постоянное представительство Республики Алтай при Президенте РФ в 2006 году переименовано в Постоянное представительство Республики Алтай в г. Москве.

Сегодня представительство возглавляет заместитель Председателя Правительства Республики Алтай, полномочный представитель Республики Алтай в г. Москве Лозовая Ирина Петровна. В представительстве трудятся 8 человек.