Антинаркотическая комиссия Республики Алтай создана в соответствии с Указом Президента РФ от 18.10.2007 г.  № 1374 «О дополнительных мерах по противодействию незаконному обороту наркотических средств, психотропных веществ и их прекурсоров» с целью координации деятельности территориальных органов федеральных органов исполнительной власти, органов исполнительной власти Республики Алтай и органов местного самоуправления муниципальных образований по противодействию незаконному обороту наркотических средств, психотропных веществ и их прекурсоров, а также для осуществления мониторинга и оценки развития наркоситуации в регионе.

В Республике Алтай Антинаркотическая комиссия создана указом Главы Республики Алтай, Председателя Правительства Республики Алтай от 26 сентября 2017 года № 229-у «Об утверждении состава антинаркотической комиссии Республики Алтай».